“十五”期间，我州增加农业投入，大力推广科学种田，积极发展“两高一优”农业，极大地提高了农业生产的科技含量。通过积极调整和优化农业种植结构，农作物种植面积呈现“一减两增”，即粮食种植面积减少，经济作物和青饲料面积增加。通过调整种植结构，农业生产总量增加。
　　全州通过抓项目、建设农业科技示范园区，提高了农业科技在农业生产中的应用，给农业生产的发展奠定了基础。“十五”期间，全州实施了甘南州藏区青稞生产基地建设、甘南州万亩藏中药材基地建设、野生藏中药材人工驯化栽培试验、兰郎文明线青稞良种繁育基地建设、“双低”油菜新品种引进推广、甘南州农作物病虫综合防治等项目。建设各类农业科技示范园区和示范村42个，面积9600亩。示范推广了“四位一体”日光温室蔬菜生产技术、野生藏中药材人工驯化技术、地膜冬播洋芋栽培技术等，辐射带动面积达11万亩。同时，大力推广农业实用技术，提高农业机械在生产中的运用。2005年，全州农业增加值达32441万元，比2000年增加了7249万元，年均增长6.23％。全州粮食播种面积为63.11万亩，比2000年减少12.73万亩，下降16.79％；经济作物播种面积28.17万亩，增加10.49万亩，增长59.33％；青饲料播种面积9.69万亩，增加1.36万亩，增长16.33％。粮、经、饲比由“九五”末的74.46：17.36：8.18，调整为“十五”末的62.50：27.90：9.60。农业机械总动力达19.86万千瓦，比2000年增加3.49万千瓦，增长21.32％，年均增长3.94％。农业科技的应用，给农业生产的发展奠定了坚实的基础。
　　“十五”末，全州农业生产在遭受严重自然灾害的情况下，粮食亩产仍然比获得丰收的“九五”末增加，2005年，全州粮食亩产15233公斤，比2000年提高142公斤。由于调整种植结构，压缩了粮播面积，粮食总产量减少，全州粮食总产为96137吨，减少18316吨，下降16.00％。“十五”期间，全州紧紧围绕农业增效、农民增收的目标，经济作物种植面积持续增加，主要经济作物增产。2005年，全州油料产量达15092吨，比2000年增加4563吨，增长44.57％。药材达16532吨，增加11854吨，增长2.53倍。蔬菜12965吨，增加7023吨，增长18.19％。