通过多方积极协调、申报，在“十一五”开局之年，甘南藏族自治州的重点环保工程项目达7项，总投资金额将达43.654亿元，创该州环保项目投资额历史之最。
这些重点环保工程项目是：环境监管能力建设方面，将投资3013万元，投资额列全省14个市州第一位；城市污水处理工程共列7项，投资13291万元；城市垃圾处理工程7个，投资85896万元；玛曲国家级生态功能保护区建设项目，投资169290万元；甘肃甘南黄河重要水源补给区生态保护与建设，投资158300万元；干酷素山区经济产业化示范项目投资2900万元；玛曲格尔柯金矿污染治理3500万元。
同时甘南黄河重要水源补给区建设项目，已列人国家《国民经济和社会发展第十一个五年规划纲要》，规划总投资66.4亿元。重点加强天然林、湿地和高原野生动植物保护，实施退耕还林还草、牧民定居和生态移民等。
