根据农业部农科教发[2011]3号文件《关于印发现代农业产业技术体系建设依托单位和岗位聘用人员名单（2011—2015年）的通知》，甘南州畜牧科学研究所被选为国家肉牛牦牛产业技术体系甘南综合试验站建设依托单位，是甘南州唯一一个进入国家现代农业产业技术体系的依托单位。   
    国家现代农业产业技术体系是按照优势农产品区域布局规划，依托具有创新优势的中央和地方科研资源，针对每一个大宗农产品设立一个国家产业技术研发中心（由若干功能研究室组成），并在主产区建立若干个国家产业技术综合试验站。主要职能是围绕产业发展需求，进行共性技术和关键技术研究、集成和示范；收集、分析农产品的产业及其技术发展动态与信息，为政府决策提供咨询，向社会提供信息服务，为用户开展技术示范和技术服务，为产业发展提供全面系统的技术支撑；推进产学研结合，提升农业区域创新能力，增强我国农业竞争力。在管理机制上，通过设立管理咨询委员会、执行专家组和监督评估委员会等，确保决策、执行和监督三个层面权责明晰、相互制约、相互协作。调整和完善优势农产品区域布局规划，明确以产业需求为导向的建设现代农业产业技术体系的基本思路。