2011年12月16日，由甘肃省科技厅组织、甘南州科技局主持，邀请有关专家组成鉴定委员会，对甘南州畜牧科学研究所、甘肃农业大学共同完成的“合作猪种质资源保护及利用研究” 项目（农财发[2009]99号）进行了科技成果鉴定。鉴定委员会通过听取汇报、审阅有关资料、质疑评议后，形成如下意见：
    1、在合作猪主产区建立了农牧联户保种基地，采取封闭式繁育自然交配的形式进行活体保种，组建4个选育核心群200头，3个扩繁群300头，为合作猪种质资源保护奠定基础。
    2、放牧和舍饲两种饲养方式对合作猪肉品质及成熟特性对比研究表明，两种饲养方式对猪肉营养成分无显著性影响，合作猪适宜舍饲养殖。
    3、利用微卫星DNA（SSR）分析技术及mtDNA D-loop序列分析技术，对12个微卫星座位的7个群体282个个体分析，发现了180个等位基因，为遗传资源利用与产品开发提供了科学依据。
    4、制定的甘肃省地方标准《蕨麻猪肉》（DB62/T1861—2009）、《蕨麻猪（合作猪）选育技术规程》（DB62/T2184—2011），为合作猪保护与利用起到了指导作用。
    鉴定委员会一致认为，该项目密切结合生产实际，试验设计合理，技术路线正确，资料翔实，符合国家遗传资源保护技术规范与要求。成果达到同类研究的国内领先水平，同意通过科技成果鉴定。
    建议在活体保种的基础上，开展遗传资源保护方面的研究。