甘南州畜牧科学研究所注重科研工作，以推动甘南畜牧业发展，提高畜产品质量，繁荣畜产品市场，增加农牧民收入为目的，坚持以人为本、科学发展，采取多形式的激励机制，结合全州畜牧工作实际，引导专业技术人员积极参与科研活动，取得了显著成果。今年以来，所里主持的“甘南蕨麻猪、藏系绵羊肉用品质、血清生化指标及其相关研究”项目获甘肃省科技进步三等奖，“甘加羊选育及利用研究”项目获甘肃省农牧渔业丰收二等奖，“ 甘南州半农半牧区标准化暖棚建设和牛羊科学饲养技术研究与试验示范”项目、“合作猪（甘南蕨麻猪）与其他品种猪肉品质的对比研究”项目及“甘南牦牛与其它良种牛肉品质对比研究”项目获甘肃省农牧渔业丰收三等奖。